公司发工资未申报，违反了个人所得税代扣代缴义务，法律依据如下：
2018年版《中华人民共和国个人所得税法》第二条明确，工资、薪金所得需缴纳个税。公司作为工资支付方，是法定扣缴义务人。《税收征收管理法》第三十条规定，扣缴义务人须依法代扣代缴税款。公司未申报发工资，即未履行此义务，违反上述法律。若违反《税收征收管理法》第六十九条，扣缴义务人应扣未扣税款的，税务机关将向纳税人追缴税款，并处应扣未扣税款50%至3倍罚款。因此，公司可能被罚款，且需协助员工补缴税款。
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公司发工资未申报时，以下错误操作会增加风险：
1. 拖延或隐瞒不报：部分公司侥幸拖延或隐瞒，根据《税收征收管理法》第五十二条，税务机关可在3年内追征税款、滞纳金；特殊情况追征期可延至5年。拖延越久，滞纳金越多，还可能被认定为偷税，面临更高罚款。
2. 擅自调整工资数据：个别公司为少补税，伪造工资记录或降低申报基数，这属于《税收征收管理法》第六十三条规定的偷税行为，将处不缴或少缴税款50%至5倍罚款，情节严重者追究刑事责任。
3. 忽视员工沟通：未申报工资可能导致员工个税申报异常，影响征信或年度汇算。若公司未及时与员工沟通补税，可能引发投诉或劳动争议，扩大法律风险。
若您已犯错或不确定如何纠正，可随时联系我，我会为您评估风险并制定应对方案。
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以下特殊情况或例外情形可能影响公司发工资未申报问题的处理结果：
1. 因不可抗力未申报：若公司能证明未申报系不可抗力（如地震、系统瘫痪等）导致，且在不可抗力消除后立即补报，税务机关可依据《税收征收管理法实施细则》第四十一条，酌情减免滞纳金或不予罚款。例如，某公司因财务系统遭黑客攻击丢失数据，3日内恢复并补报且提供公安机关证明，税务机关仅要求补缴税款，未予罚款。
2. 员工已自行申报缴税：若员工已就未申报工资自行申报并缴税，公司法律责任会减轻。根据《税收征收管理法》第六十九条，税务机关追缴税款后，对公司的罚款可能降低至应扣未扣税款的50%以下，但公司仍需承担未履行代扣代缴义务的责任。
3. 首次违法且情节轻微：对于首次未申报工资、税款金额较小（如低于1万元），且在税务机关发现前主动改正的公司，税务机关可依据《税务行政处罚裁量权行使规则》，适用“首违不罚”或从轻处罚，仅责令限期改正，不予罚款。
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公司发工资未申报可能面临以下法律风险，结合实例说明：
1. 税务行政处罚风险：税务机关可对公司处以高额罚款。例如，某公司2022年1-6月向10名员工发放工资50万元，未申报导致应扣未扣税款8万元。税务机关查实后，依据《税收征收管理法》第六十九条，对该公司处以4万元（50%罚款），并要求其协助员工补缴8万元税款及滞纳金。
2. 信用评级下降风险：未申报行为可能影响公司纳税信用等级。根据《纳税信用管理办法（试行）》，未按期申报每次扣5分，应扣未扣税款每次扣3分。若公司纳税信用等级降至D级，将面临增值税专用发票领用受限、普通发票严格限量供应等限制，严重影响经营。

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